Akupunktion avulla hoidetaan tuki- ja liikuntaelimistön kiputiloja. Hoidon tavoitteena on herätellä elimistön omaa kivunlievitysjärjestelmää, sekä saada lihaksisto rentoutumaan.
Akupunktiota käytetään paljon apuna niska-hartiaseudun, selän ja olkapään kiputiloihin sekä erilaisiin päänsärkyihin ja migreeniin. Tutkimusnäyttö akupunktion toiminnasta näiden kiputilojen hoidossa on vahvaa. Kipua lievittävä mekanismi perustuu erilaisten endorfiinien erittymiseen sekä porttikontrolliteoriaan, jossa osa kipuaistimusta lähettävistä hermopäätteistä pysäytetään selkäydintasolla.